2006年1月6日 贈臺大熊貓選定 國臺辦和國家林業(yè)局宣布16號、19號大熊貓“勝出”為贈臺大熊貓，民眾起名“團團”、“圓圓”
1月20日 2006年兩岸春節包機 兩岸各6家航空公司各執行36個(gè)往返班次，總計72個(gè)往返班次。并于2月7日圓滿(mǎn)結束。
4月中旬 兩岸經(jīng)貿論壇 14日兩岸經(jīng)貿論壇在北京舉行，15日論壇閉幕并通過(guò)“共同建議”。中臺辦主任陳云林授權宣布大陸未來(lái)進(jìn)一步“促進(jìn)兩岸交流合作、惠及臺灣同胞的15項政策措施”。16日，國家旅游局、公安部和國務(wù)院臺辦等三部門(mén)聯(lián)合發(fā)布《大陸居民赴臺灣地區旅游管理辦法》。
4月16日 二度“胡連會(huì )” 中共中央總書(shū)記胡錦濤與國民黨榮譽(yù)主席連戰舉行二次“胡連會(huì )”，胡錦濤就推動(dòng)兩岸關(guān)系和平發(fā)展提出四點(diǎn)建議。
6月14日 兩岸就客運包機節日化和開(kāi)辦專(zhuān)案包機達共識 經(jīng)過(guò)海峽兩岸航空運輸交流委員會(huì )與臺北市航空運輸商業(yè)同業(yè)會(huì )多次協(xié)商，就兩岸客運包機節日化和開(kāi)辦專(zhuān)案包機的技術(shù)性、業(yè)務(wù)性問(wèn)題達成共識。經(jīng)雙方業(yè)務(wù)主管部門(mén)認可，這個(gè)安排自即日起實(shí)施。這意味著(zhù)，兩岸客運包機將從原來(lái)的春節包機擴大到清明、端午、中秋、春節四個(gè)主要民族傳統節日期間的兩岸包機。
7月10日 2006年臺胞青年千人夏令營(yíng) “2006年臺胞青年千人夏令營(yíng)”10日晚在北京開(kāi)營(yíng)。來(lái)自臺灣島內、港澳、海外以及在大陸求學(xué)的1300多位臺灣同學(xué)對于在6天中“有機會(huì )深入交流、認識彼此”。此次夏令營(yíng)以“龍脈相傳，青春中華”為主題，是2004、2005年以來(lái)全國臺聯(lián)第三次舉辦兩岸最大規模青年學(xué)生交流活動(dòng)。
9月7日 閩臺經(jīng)濟合作促進(jìn)委員會(huì )成立 閩臺經(jīng)濟合作促進(jìn)委員會(huì )7日在廈門(mén)成立，福建省委書(shū)記盧展工任名譽(yù)主任，福建省長(cháng)黃小晶任主任。聘請何厚鏵、張榮發(fā)、高清愿、郭臺銘等港澳臺以及東南亞知名人士27人擔任顧問(wèn)。
9月18日 兩黨臺商權益保障工作會(huì )談 國民黨副主席江丙坤率團訪(fǎng)京與中共中央臺辦副主任鄭立中等人舉行第二次兩黨臺商權益保障工作會(huì )談，會(huì )后達成十項共識。
9月27日 臺灣史上最龐大跨海進(jìn)香團廈門(mén)謁祖 24日，約6000名信眾分別搭乘飛機、客輪轉往廈門(mén)謁祖。27日，4300多人的臺灣媽祖聯(lián)誼會(huì )大型進(jìn)香團與在大陸的2700百余名臺商、臺胞，以及當地民眾、游客共1萬(wàn)余人聚集在位于福建莆田湄洲島的媽祖祖廟，舉行大型謁祖進(jìn)香祭祀大典，為有史以來(lái)最大規模的臺胞來(lái)大陸交流團。
10月16日 兩岸農業(yè)合作論壇 16日兩岸農業(yè)合作論壇在海南博鰲舉行。全國政協(xié)主席賈慶林就進(jìn)一步推進(jìn)兩岸農業(yè)交流與合作提出四點(diǎn)建議。國民黨榮譽(yù)黨主席連戰指出，為提升兩岸農業(yè)的競爭力，首先要突破“三通”的障礙。論壇并通過(guò)共同建議，大陸推出20項深化兩岸農業(yè)合作的新措施。
10月30日 海峽兩岸醫療合作與交流論壇 為期兩天(30、31日)的“2006海峽兩岸醫療合作與交流論壇”在京舉行，論壇就進(jìn)一步加強和深化海峽兩岸醫療衛生合作與交流，提出七項共同建議。
11月6日 李炷烽提“金廈和平特區” 金門(mén)縣長(cháng)李炷烽提出，在“一國兩制試驗區”的架構下，成立“金廈和平特區”。
11月6日 首屆“海峽兩岸法學(xué)論壇” 首屆“海峽兩岸法學(xué)論壇”在京舉行，海峽兩岸150余位法學(xué)界知名學(xué)者、經(jīng)濟界、企業(yè)界與相關(guān)部門(mén)人士在此間出席首屆“海峽兩岸法學(xué)論壇”，討論“兩岸貿易與投資保護”。
11月11日 “海峽兩岸客家高峰論壇” 11日，海峽兩岸客家高峰論壇在北京舉行，來(lái)自大陸、臺灣、香港的近200名各界客家菁英應邀與會(huì )。
12月4日 兩岸就大陸居民赴臺游磋商并交換意見(jiàn) 據海峽兩岸旅游交流協(xié)會(huì )相關(guān)負責人介紹，近日，海峽兩岸旅游交流協(xié)會(huì )與臺灣海峽兩岸觀(guān)光旅游協(xié)會(huì )，就大陸居民赴臺旅游事宜又進(jìn)行了技術(shù)性磋商，雙方就相互關(guān)心的問(wèn)題交換了意見(jiàn)。
12月13日 2007年兩岸春節包機時(shí)間確定 從2007年2月5日開(kāi)始，包機運行時(shí)間為春節前后各14天。在此期間，雙方各執行48個(gè)往返班次，共計96個(gè)航次，飛行航點(diǎn)和2006年的春節包機一樣，即北京、上海、廣州、廈門(mén)和臺北、高雄。
12月13日 海峽兩岸大學(xué)校長(cháng)論壇 “海峽兩岸大學(xué)校長(cháng)論壇”在福州舉辦。經(jīng)過(guò)一天半的研討，為促進(jìn)兩岸高等教育的創(chuàng )新，與會(huì )的兩岸大學(xué)校長(cháng)達成了四點(diǎn)共識。
12月15日 兩岸青年論壇 中國共產(chǎn)主義青年團與中國國民黨青年團在北京共同舉辦兩岸青年論壇，并發(fā)表四點(diǎn)共識。這是國共兩黨青年組織首次共同開(kāi)展的交流活動(dòng)，是兩黨交流領(lǐng)域的進(jìn)一步拓展。
12月16日 北京公布臺胞捐資建設奧運情況 北京市僑辦主任喬衛表示，港澳臺僑同胞捐資建設的2008年北京奧運場(chǎng)館——國家游泳中心到位的捐贈資金目前已超6.5億元人民幣，其中來(lái)自臺灣的捐贈金額約6000萬(wàn)人民幣。
12月22日 第三屆京臺環(huán)�？萍冀涣鲿�(huì ) 由臺盟中央與北京市科學(xué)技術(shù)委員會(huì )共同舉辦的第三屆京臺環(huán)�？萍冀涣鲿�(huì )在北京舉行，來(lái)自臺灣環(huán)境工程技師工會(huì )的專(zhuān)家、學(xué)者、企業(yè)代表20余人，北京專(zhuān)家、企業(yè)代表60余人參會(huì )。(中新網(wǎng)整理)
